Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC18A2Q05940 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms