Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ERCC6Q03468 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERCC6Q03468 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms