Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms