Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MS4A2Q01362 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MS4A2Q01362 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms