Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTBN1Q01082 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms