Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRF9Q00978 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms