Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSG4Q00888 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms