Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDC42EP1Q00587 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms