Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3AP98173 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FAM3AP98173 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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