Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS28P62857 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS28P62857 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS28P62857 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS28P62857 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS28P62857 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS28P62857 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms