Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP4P57796 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP4P57796 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP4P57796 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP4P57796 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABP4P57796 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABP4P57796 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms