Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN12P56749 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms