Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms