Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TPTEP56180 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TPTEP56180 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TPTEP56180 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TPTEP56180 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TPTEP56180 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TPTEP56180 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TPTEP56180 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TPTEP56180 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TPTEP56180 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TPTEP56180 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TPTEP56180 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TPTEP56180 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TPTEP56180 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms