Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAG2P55895 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAG2P55895 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms