Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC16A1P53985 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms