Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ETV1P50549 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV1P50549 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV1P50549 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV1P50549 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV1P50549 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV1P50549 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV1P50549 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ETV1P50549 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ETV1P50549 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms