Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KRT6CP48668 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT6CP48668 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms