Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCLMP48507 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GCLMP48507 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GCLMP48507 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GCLMP48507 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GCLMP48507 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCLMP48507 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCLMP48507 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCLMP48507 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms