Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms