Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTX2P32243 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OTX2P32243 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms