Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TSPOP30536 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TSPOP30536 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TSPOP30536 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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