Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJB2P29033 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB2P29033 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB2P29033 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB2P29033 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms