Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB5P28074 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB5P28074 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms