Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMA5P28066 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMA5P28066 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms