Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms