Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRBP23467 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRBP23467 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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