Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1P21675 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1P21675 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1P21675 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1P21675 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1P21675 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1P21675 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF1P21675 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TAF1P21675 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1P21675 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1P21675 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1P21675 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms