Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZKSCAN1P17029 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZKSCAN1P17029 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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