Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL3L1P16619 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL3L1P16619 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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