Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREB1P16220 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREB1P16220 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREB1P16220 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms