Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HPGDP15428 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HPGDP15428 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPGDP15428 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPGDP15428 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPGDP15428 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPGDP15428 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPGDP15428 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPGDP15428 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPGDP15428 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPGDP15428 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPGDP15428 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPGDP15428 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HPGDP15428 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
HPGDP15428 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HPGDP15428 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HPGDP15428 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HPGDP15428 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HPGDP15428 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPGDP15428 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPGDP15428 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPGDP15428 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPGDP15428 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPGDP15428 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPGDP15428 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms