Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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