Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms