Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM10L1P0DMW3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM10L1P0DMW3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms