Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRCP08575 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRCP08575 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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