Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSF2P04141 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSF2P04141 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF2P04141 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF2P04141 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF2P04141 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms