Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C6orf47O95873 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C6orf47O95873 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms