Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DDX58O95786 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX58O95786 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX58O95786 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms