Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC24BO95487 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms