Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms