Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETD1AO15047 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD1AO15047 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms