Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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