Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE40O14503 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms