Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms