Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
USP17L12C9JPN9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP17L12C9JPN9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms