Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HNRNPCL3B7ZW38 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms