Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IDSB3KWA1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IDSB3KWA1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IDSB3KWA1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IDSB3KWA1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IDSB3KWA1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IDSB3KWA1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IDSB3KWA1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms