Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGPD3A6NKT7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGPD3A6NKT7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms