Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIPT2A6NK58 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms